根据财政部 国家税务总局（财税字[1994]14号） [全文废止]文件中“根据国务院决定，对增值税一般纳税人销售自来水比照对县以下小型水力发电和部分建材等商品的征税规定”，可按6%征收率征收增值税。但是不得开具专用发票。
参考最新规定——
自来水企业纳税人应从四个方面关注增值税政策的变化
国税发[2002]56号关于自来水行业增值税政策问题的通知
财税[2009]9号 关于部分货物适用增值税低税率和简易办法征收增值税政策的通知